10 基因家族共线性绘图时

运行程序时出现下列问题:

attachments-2019-09-x16X3ETy5d809463f2dd5.png

AT.gff格式如下:

attachments-2019-09-X3Fa42KF5d80947d01ca5.pngAT.collinearity格式如下:

attachments-2019-09-lfBo77BM5d80949a486a5.png

做的是水稻的一个基因家族,用的文件(AT.gffAT.collinearity)做基因加倍分析绘图,circos没有问题,怀疑是family.ctl,或者MADS_box_family.txt文件出现问题,

其中family.ctl文件如下:

attachments-2019-09-GnCryZES5d8094af2b79d.png

MADS_box_family.txt格式如下:

attachments-2019-09-8yyYFJW45d8094c281752.png

1 个回答

安生水
擅长:perl,基因家族,linux,chip-seq

应该是你的输入文件有问题,仔细检查一下。另外这个图可以不做,有circos绘制的图就可以了

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  • *雪狐* 提出于 6天前

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